病原体的物理学检测手段可以同时检测病原体种类及抗生素耐药性 等其他特征。
实验室应用传统方法检测细菌常需要8-18个小时，质谱技术直接对微生物细胞进行检测， 样品的制备简单，检测时间仅需数分钟，明显短于传统方法。质谱技术可以大幅减少技 术人员的操作时间，可以实现高通量药物筛选、药物定量分析，提高实验室效率。
通过采用质谱技术，实验室可以鉴定出细菌的型、属、种，并且可以将相似甚至是相同 的菌株进行区分，并且保持非常高的准确性，准确率在 90%~95%， 同时还有可能再检 测过程中发现新的病原菌。
除了对多种细菌以及真菌进行鉴定外，质谱技术还可对血液、尿液、脑脊液等微生物进 行测定。质谱分析技术可应用于多种病原体鉴定与分类检测，并可对病原的成分进行分 析，比如蛋白质、DNA、多肽及其他可被离子化的分子。
质谱技术与气相色谱、液相色谱、毛细管电泳等分离技术结合，提高了检验分析的灵敏 度、可靠性和分析效率，从而可被广泛运用到代谢组、基因组、蛋白组等多组学研究。 质谱技术将成为检验科未来发展的重要亚专业，基于质谱技术的疾病诊断方法 将成为重 要的临床检验诊断技术
