量子计算基准测评仍面临诸多技术挑战性。
一是量子计算有多种 技术路线并存发展，针对各类型系统方案的测评基准难以完全一致；
二是各技术路线和样机研发仍在快速迭代发展，现有系统进行分析和 衡量的某些指标，未来可能并不适用；
三是量子计算的应用案例尚未 完全明确，面向不同应用环境和条件的基准测评难以完全对应；
四是 基准测评需提供量子计算和经典计算之间的算力对比，但经典计算的 算法研究也在持续更新，为对比带来不确定性。例如量子计算优越性 证明，对比经典计算的运算时间优势，就不断受到新算法的挑战。
