2026年第4周医药行业产业研究周报:Illumina十亿细胞图谱,揭开生命“因果”;监管推动创新更快,CXO恒强

产业前沿

前沿动向:Illumina 发布 Billion Cell Atlas,生命数据步入 AI 新纪元

2026 年 1 月 13 日,Illumina 在摩根大通医疗保健大会上,正式发布了 Billion Cell Atlas(十亿细胞图谱),这是迄今为止规模最大的人类全基因组扰动数据 集,旨在通过人工智能加速药物发现与机制研究。Illumina 十亿细胞图谱是其三 年内构建 50 亿细胞图谱计划的首批成果,并将成为迄今为止最全面的人类疾病 生物学图谱。我们认为,这将推进生命科学数据基础设施的发展并开启生物学 与 AI 交汇的全新阶段。要点有三:(1)数据入口龙头转型:从测序硬件转向 高效 AI 数据提供商;(2)AI 新生态:跨界龙头组队构建颠覆性的生命科学新 数据;(3)生命科学的可计算新纪元:数据基建变革推动 AI 医药新纪元,就 像原始人类凭借肉眼所见在崇山峻岭中半盲目攀登,进化到今天通过卫星导航 对环境地貌了然于胸的有效前行,人类难治疾病的破解将进入 AI 驱动的新纪 元。

十亿细胞图谱:Illumina 的 Billion Cell Atlas,本质是可用于 AI 药物发现的 “基因扰动×单细胞响应”数据集。这一数据集不仅可用于从基因扰动层面 理解细胞行为,还可帮助探索药物或疾病机制、发现新适应症并验证基因靶 点,与传统基因测序和表型分析不同,其强调基于真实生物响应的 AI 训练 基础,有望推动从经验驱动向模型驱动的药物发现模式转变。

该图谱将捕捉超过 200 种与疾病相关的细胞系中,10 亿个细胞如何通过 CRISPR(成簇规律间隔的短回文重复序列)技术对基因改变做出反 应。这些细胞系均经过精心挑选,与多种疾病密切相关,其中许多疾病 的基因表达机制历来难以解析,包括免疫系统疾病、癌症、心血管代谢疾病、神经系统疾病以及罕见遗传疾病。CRISPR 技术使研究人员能够 快速研究开启和关闭体内关键细胞类型中全部 2 万个基因所产生的影 响。

根据 Fintool 官网发布,Illumina 正在创建的这个庞大训练数据集,揭示 基因变化与细胞行为之间的因果关系。该数据库的具体工作流程如下图 所示,通过细胞培养、Crispr 剪辑干扰、单细胞测序再到 AI 分析和药物 发现的产出。

IVD 龙头的 AI 数据转型:根据 Fintool 对 Illumina 这次发布的报道,公司此 次发布十亿细胞图谱,标志着其战略转型,从测序硬件供应商转型为人工智 能驱动的药物发现数据提供商。正如公司 CEO 雅各布·泰森在大会上的演 讲表示,此项细胞图谱是一项关键进展,它将大幅扩展人工智能在药物发现 领域的应用。公司正在构建一个史无前例的资源,用于训练下一代人工智能 模型,以实现精准医疗和药物靶点识别。

根据 Illumina 官网,Altas(细胞图谱)是公司全新 BioInsight 业务推出 的首款数据产品。Atlas 的规模之大,唯有借助 Illumina 单细胞 3' RNA 制备平台才能实现,该平台能够在单次实验中捕获数百万个单细胞。 Atlas 将在一年内生成 20PB 的单细胞转录组数据。为了处理如此庞大的 数据量,单细胞 RNA 测序数据将使用 Illumina 的 DRAGEN 流程进行处 理,并借助硬件加速技术,最终托管在 Illumina Connected Analytics 云 平台上,以实现可扩展的分析。 Illumina 新成立的 BioInsight 业务部门旨在提供基础技术和数据集, 以推动下一代药物发现和制药领域人工智能的发展。通过推出 Illumina 十亿细胞图谱,并开发全面的、疾病特异性的扰动数据集以及先进的人工智能算法,Illumina 正在推进下一代细胞建模技术的发 展。

AI 新生态:跨界合作造就颠覆性突破涌现。根据 Illumina 官网新闻稿发布, 在以阿斯利康、默克和礼来公司为创始参与者的联盟框架下,Atlas(细胞图 谱)已经建成,用于收集一系列精选的细胞系,以推动药物靶点验证、大规 模训练先进的 AI 模型,并推进对以前难以触及的基本疾病机制的研究。我 们认为,这不只是 AI 在制药研发领域应用的颠覆性的数据突破,更是 AI 赋能时代跨界合作造就突破的起始信号。对于全球药企来说,AI 赋能或驱动已 经不是可选项,而生存与发展的必配项。

Fintool 官网的这张示意图。形象地展示了阿斯利康、默克及礼来与 Illumina 合作的模式。我们相信,此类合作将是医药医疗行业 AI 跨界合作的新常态。

生命科学的可计算新纪元:从解码人类基因构成,到推理细胞运行因果,生 命科学打开可推算的新世界。从 1990 年启动的人类基因组计划(HGP)、 千基因组项目,到单细胞多组学图谱,再到 Billion Cell Atlas,生命科学数 据基础经历了连续升级。这一图谱实现了从静态基因序列到可计算、多维度细胞响应数据的跃迁,为 AI 驱动的机制研究、药物发现和疾病理解提供了 可训练的数据底盘。

1990 年启动的人类基因组计划(Human Genome Project, HGP),这 是一项国际合作科研计划;于 1990 年 10 月正式启动,由美国国立健康 研究院(NIH)与美国能源部共同资助,随后吸引了来自英国、法国、 德国、日本、中国等多个国家和地区的科研机构参与,目标是确定构成 人类 DNA 的全部碱基对序列并识别所有基因。该计划历时约 13 年, 于 2003 年 4 月实现了 90%以上人类基因组的序列测定,为全球研究者 提供了第一个详细的参照人类基因组序列。HGP 的完成不仅推动了高 通量测序技术和生物信息学的发展,还极大促进了对人类遗传变异与疾 病关联的基础研究。2003 年 4 月的美国 NIH 官网报道,对人类基因组 中 30 亿个 DNA 碱基进行测序的国际合作项目被许多人认为是史上最雄 心勃勃的科学事业之一,即使与分裂原子或登月相比也毫不逊色。

千基因组计划(1000 Genomes Project),是 HGP 之后的重要国际科 研合作,其成员包括来自美国、中国、德国和英国的研究人员。该计划 从 2008 年 1 月开始持续至 2015 年,当时旨在建立最详细的人类遗传变 异目录。研究者计划对至少 1000 名不同族裔背景的匿名健康个体的基 因组进行测序,并据此构建精细的人类基因组图谱。该项目涉及来自全 球多个民族群体的样本。

这项计划最初的目标是识别并编录 95%的常见人类基因组变异。最 终,“千人基因组计划”不仅编录了超过 99%的常见人类基因组变异,还包括许多罕见变异。最终测序了 2504 个体的全基因组并鉴定了数 千万种基因变异。2015 年 10 月,项目主要成果在《Nature》上发 表,形成了覆盖>99%常见变异的全球人类遗传变异资源,为关联性 研究、疾病风险分析和药物靶标识别等提供了重要基础数据。

单细胞多组学图谱计划,是由阿维夫·雷格夫博士和萨拉·泰希曼博士, 于 2016 年共同创立的一个全球协作科研联盟 Human Cell Atlas(人类细 胞图谱 HCA)发起的。旨在绘制人类生命周期中所有细胞类型的图谱, 以推动全球医疗保健和医学的重大进步。 首个人类细胞图谱草案正在构建中,该图谱涵盖了 18 个重要器官和 组织,例如心脏、肝脏和免疫系统。肺、神经系统、眼睛和类器官生 物网络的首批图谱已在 HCA 数据门户网站上发布,更多图谱将在未 来一年内陆续推出。首人类细胞图谱计划将创建一个覆盖全身的三 维、全球代表性图谱。 2022 年 5 月,HCA 在《科学》杂志发表了四项多组织人类细胞图谱 研究。这些涵盖 33 个器官和系统的超过一百万个细胞的精细图谱, 使人类细胞图谱绘制计划(HCA)——即绘制人体内所有细胞类型 的图谱——的目标更进一步。 2023 年 6 月,HCA 在 Nature(自然杂志)发布人类细胞图谱整合 了近 40 项研究的数据,首次将主要器官纳入其中,为肺部疾病的研 究提供了新的视角。人类肺细胞图谱揭示了肺部细胞类型的多样性,以及健康状态与疾病状态之间的关键差异。

监管动态:中国落地 eCTD,美国支持贝叶斯方法,时速比拼再升级

上周,中美药监共用一个关键词:更快。NMPA(中国国家药监局)发布关于 化学药品和生物制品全面实施药品电子通用技术文档申报的公告,2026 年 3 月 1 日起来执行。新药申报全面提速。FDA(美国食药监局)发布指导草案,系统 性支持在药物与生物制品临床试验中采用贝叶斯统计方法,目的是促进临床试验提速。我们认为,随着 AI 赋能新药研发与监管提效加速,创新药研发的速度 比拼将进一步升级。因此,在同类分子中谋求快速跟随达到胜出的策略,可能 需要转变;靠工程师红利或仅靠运行高效来获得同类竞品更优更快更好性价比 的路径,或将面临挑战。

2026 年 1 月 14 日,国家药监局官网发布关于化学药品和生物制品全面实施 药品电子通用技术文档申报的公告。此项 eCTD 实施目的,是为加强药品全 生命周期监管和数智监管,提高药品审评审批质效,加快推进药品电子通用 技术文档(eCTD)在我国的实施进程,提升“互联网+药品监管”应用服务 水平。

自 2026 年 3 月 1 日起,化学药品、化学原料药和生物制品的药物临床 试验申请、药品上市许可注册申请、补充申请、境外生产药品再注册申 请以及仿制药一致性评价申请等,可按照 eCTD 方式申报。采用 eCTD 方式申报的,申请人按照修订后的 eCTD 相关技术文件要求准备和提交 eCTD 电子申报资料。

自 2026 年 3 月 1 日起 1 年内,将采用 eCTD 方式申报的药品上市许可 申请纳入开展受理靠前服务范围;在受理审查环节,对采用 eCTD 方式 申报的药品注册申请单独排队,3 日内完成受理审查。

2026 年 1 月 12 日,FDA 发布关于临床试验统计方法现代化的指导意见草 案,旨在促进在药物和生物制剂的临床试验中使用贝叶斯方法,帮助药物研 发人员更好地利用现有数据,开展更高效的临床试验,并更快地为患者提供 安全有效的治疗。


(本文仅供参考,不代表我们的任何投资建议。如需使用相关信息,请参阅报告原文。)

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